39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1673 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  57.97 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  50.72 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  44.93 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  39.13 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  43.48 
 
 
679 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  40.62 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  43.08 
 
 
709 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  34.78 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  43.75 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  45.71 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
561 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  37.68 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  38.03 
 
 
72 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  37.68 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
573 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  37.68 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  35.94 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
573 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
573 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2626  hypothetical protein  39.58 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000563687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  36.07 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  37.29 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  37.1 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  36.07 
 
 
69 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
58 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>