17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0329 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 58 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  73.68 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  46.3 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 573 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 573 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 573 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  37.04 
 
 		 709 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 561 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  29.31 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  35.19 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  44.44 
 
 		 679 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  32.73 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  34.55 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  29.63 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>