29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1648 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  60.56 
 
 
74 aa  98.2  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  40.58 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  45.31 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  48.44 
 
 
679 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  45.31 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  40.62 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  40.85 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
573 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 
573 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
573 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  34.85 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  32.79 
 
 
69 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  34.38 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  36.21 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3238  hypothetical protein  28.57 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2989  hypothetical protein  28.57 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717037  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  29.31 
 
 
73 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>