27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1664 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  97.14 
 
 		 70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  75.71 
 
 		 70 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  72.86 
 
 		 70 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  41.18 
 
 		 679 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  42.42 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  41.18 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  36.76 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  37.14 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  34.38 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  34.38 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  38.1 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  35.94 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 573 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 573 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 573 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  29.23 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  34.43 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  32.35 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  31.25 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  33.82 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>