43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2492 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  47.22 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  47.22 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  44.93 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  38.57 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  44.29 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  42.03 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  53.12 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  40.58 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  36.23 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  40.98 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  39.13 
 
 		 679 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 573 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 573 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  38.71 
 
 		 709 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 561 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  31.88 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2343  hypothetical protein  33.78 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0539871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  30.43 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  30.43 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  35.94 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1648  hypothetical protein  38.71 
 
 		 114 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2626  hypothetical protein  35.42 
 
 		 49 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000563687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0567352  unclonable  0.0000000000381377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>