27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6775 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  100 
 
 		 65 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 58 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  51.56 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  41.94 
 
 		 709 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  45.16 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 573 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 573 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 561 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 573 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  36.84 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  43.55 
 
 		 679 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  32.26 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  35.48 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  30.65 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  34.92 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  27.42 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1648  hypothetical protein  35.82 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  34.43 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  38.89 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  25.81 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  32.26 
 
 		 66 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>