30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4475 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  51.56 
 
 		 709 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  44.44 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  45.9 
 
 		 679 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 573 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  39.29 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 573 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  40 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 573 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  34.29 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  39.58 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>