117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1907 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1907  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166324  hitchhiker  0.00448137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2197  transport-associated  94.17 
 
 		 281 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0700443  decreased coverage  0.00932222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0498  transport-associated  49.54 
 
 		 290 aa  215  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3764  hypothetical protein  34.46 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.831681  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  33.76 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  32.47 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  28.98 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  31.97 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  27.84 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  26.67 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  28.24 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  27.65 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  26.56 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  32.33 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  27.27 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  27.27 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  27.27 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  27.27 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  32.48 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  32.48 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  31.51 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  33.58 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  35.81 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  34.19 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  24.72 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  31.29 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  31.29 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  31.29 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  31.29 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  31.29 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  31.29 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0194  transport-associated protein  34.65 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  25.56 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  30.61 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  23.16 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  24.19 
 
 		 191 aa  72  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0032  transport-associated  26.92 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573132  hitchhiker  0.000000102595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  28.93 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  28.93 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  30.83 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  25.89 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  31.58 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  25.62 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  23.66 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  23.66 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  28 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  30.61 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  23.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  26.45 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  22.6 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  22.6 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  22.6 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  22.6 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  32.35 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  24.18 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  23.03 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1174  transport-associated  24.32 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382619  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  36.36 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  23.03 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  23.03 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  23.03 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0628  transport-associated  27.82 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  30.51 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  28.3 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  25.17 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  28.57 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4435  putative transport protein  24.66 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  27.89 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  28.57 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  28.57 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  25.87 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  23.12 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  27.89 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  21.39 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  26.67 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  28.57 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  24.84 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2919  hypothetical protein  27.35 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3062  hypothetical protein  27.35 
 
 		 195 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  27.89 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  20.57 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  25.87 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  22.82 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  22.22 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  27.74 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>