43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0987 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 254 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  40.64 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  28.35 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  37.5 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  23.86 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  39.77 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  23.11 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  23.63 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  23.21 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  23.67 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  41.18 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  32.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  21.59 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  32.38 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  26.83 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  36.76 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  35.11 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31.09 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  33.7 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.43 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  32.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1067  hypothetical protein  28.21 
 
 		 194 aa  45.4  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0181133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  23.77 
 
 		 759 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  21.05 
 
 		 703 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>