More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0915 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  72.2 
 
 
469 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.63 
 
 
469 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.02 
 
 
474 aa  838    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.47 
 
 
470 aa  663    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.47 
 
 
469 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.28 
 
 
465 aa  699    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.71 
 
 
465 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.2 
 
 
469 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.23 
 
 
467 aa  716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.44 
 
 
474 aa  840    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.63 
 
 
469 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.49 
 
 
469 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.28 
 
 
469 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.87 
 
 
468 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.67 
 
 
464 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.71 
 
 
469 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
473 aa  986    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.87 
 
 
465 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.14 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.93 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.64 
 
 
437 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.43 
 
 
438 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.64 
 
 
434 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.46 
 
 
432 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.87 
 
 
438 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.42 
 
 
430 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.96 
 
 
438 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.58 
 
 
435 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  56.59 
 
 
449 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  56.86 
 
 
431 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.8 
 
 
436 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.02 
 
 
438 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.68 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.86 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.92 
 
 
438 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  50.7 
 
 
475 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.32 
 
 
442 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.7 
 
 
435 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.52 
 
 
470 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.6 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.63 
 
 
474 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.42 
 
 
474 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 
477 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 
478 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.42 
 
 
474 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.71 
 
 
470 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.88 
 
 
476 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 
496 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.71 
 
 
477 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 
477 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.7 
 
 
478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.22 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  50.29 
 
 
485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.36 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.6 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  49.8 
 
 
483 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.83 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  53.3 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.09 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.92 
 
 
472 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
470 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.31 
 
 
514 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.92 
 
 
472 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.6 
 
 
476 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.53 
 
 
476 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.92 
 
 
472 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  49.6 
 
 
478 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.49 
 
 
464 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.59 
 
 
471 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  49.9 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
480 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  47.74 
 
 
512 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.83 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.91 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2002  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.02 
 
 
469 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.5 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.7 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
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NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  48.61 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.3 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.39 
 
 
472 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.7 
 
 
485 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.81 
 
 
463 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  50.1 
 
 
495 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.11 
 
 
471 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.51 
 
 
472 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
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NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.91 
 
 
480 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.51 
 
 
471 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.73 
 
 
472 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
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NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.61 
 
 
472 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.6 
 
 
469 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.92 
 
 
465 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.61 
 
 
472 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.81 
 
 
463 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
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