More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1484 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1484  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
610 aa  1253    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0337  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.31 
 
 
601 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0911018  normal  0.142003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0786  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.74 
 
 
598 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.85 
 
 
593 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10450  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  36.5 
 
 
663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.87 
 
 
607 aa  310  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01441  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  34.64 
 
 
575 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  32.38 
 
 
585 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.92 
 
 
581 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1876  acetolactate synthase  31.44 
 
 
587 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646821  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  36.24 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.27 
 
 
581 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3802  acetolactate synthase large subunit  33.8 
 
 
600 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.880362  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  33.27 
 
 
554 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  32.47 
 
 
593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.11 
 
 
566 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
554 aa  253  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  31.87 
 
 
554 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 
567 aa  247  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  31.69 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  31.69 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  31.69 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  31.69 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  31.69 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  31.99 
 
 
555 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  31.99 
 
 
555 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4440  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.75 
 
 
600 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  31.8 
 
 
605 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  31.23 
 
 
562 aa  243  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.48 
 
 
581 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.48 
 
 
581 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  28.85 
 
 
589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  28.85 
 
 
589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1959  acetolactate synthase, large subunit  31.27 
 
 
570 aa  241  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  30.85 
 
 
562 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  30.67 
 
 
562 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
562 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  31.04 
 
 
562 aa  240  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  31.68 
 
 
563 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  30.67 
 
 
562 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  239  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.14 
 
 
572 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  239  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.51 
 
 
557 aa  238  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  30.1 
 
 
569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 
556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.14 
 
 
566 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.11 
 
 
548 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.68 
 
 
572 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 
548 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.63 
 
 
548 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  29.85 
 
 
578 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.74 
 
 
548 aa  233  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 
548 aa  232  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  29.06 
 
 
542 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1311  acetolactate synthase catalytic subunit  30.92 
 
 
574 aa  231  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.65 
 
 
562 aa  230  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
559 aa  230  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.79 
 
 
566 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 
548 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
569 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
562 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.75 
 
 
574 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  29.12 
 
 
585 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  30.34 
 
 
554 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.57 
 
 
571 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  30.99 
 
 
548 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
569 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.43 
 
 
564 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  30.99 
 
 
548 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.99 
 
 
548 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.65 
 
 
574 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.99 
 
 
548 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 
568 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.5 
 
 
548 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.06 
 
 
617 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.16 
 
 
570 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.74 
 
 
548 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.63 
 
 
548 aa  228  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.27 
 
 
548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.5 
 
 
548 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.32 
 
 
548 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2028  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.81 
 
 
591 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103551  normal  0.0583023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  29.62 
 
 
623 aa  226  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  30.16 
 
 
564 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.86 
 
 
573 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.87 
 
 
561 aa  226  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.22 
 
 
576 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  30.58 
 
 
562 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  31.35 
 
 
555 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.24 
 
 
552 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.63 
 
 
587 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
579 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 
575 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.44 
 
 
570 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.4 
 
 
566 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.79 
 
 
557 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>