36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1154 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  97.6 
 
 		 167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  92.41 
 
 		 158 aa  277  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  83.69 
 
 		 158 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  45.7 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  43.21 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  43.14 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  41.61 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  39.07 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.57 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.82 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  27.94 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  30.91 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.2 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  27.2 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.32 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  26.89 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  24.14 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  29.61 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  24.66 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.54 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  32.28 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  24.46 
 
 		 159 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.74 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  24 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  23.74 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.63 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>