29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4433 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.6 
 
 
423 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  80.63 
 
 
387 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  83.29 
 
 
388 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  86.08 
 
 
388 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.59 
 
 
388 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
389 aa  806    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.33 
 
 
388 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  77.58 
 
 
388 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  75.65 
 
 
386 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  75.91 
 
 
386 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.72 
 
 
387 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  46.01 
 
 
387 aa  346  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.77 
 
 
392 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  45.21 
 
 
367 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  48.66 
 
 
372 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.79 
 
 
368 aa  338  7e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  46.52 
 
 
369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.77 
 
 
401 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  45 
 
 
368 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  39.47 
 
 
375 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  37.31 
 
 
388 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.32 
 
 
378 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.41 
 
 
377 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.7 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.59 
 
 
818 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  25.27 
 
 
811 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.5 
 
 
807 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.02 
 
 
811 aa  43.5  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>