20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0841 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  66.67 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  65.38 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  59.62 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  51.66 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  45.7 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  47.02 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  39.71 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  35.25 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  39.82 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  40.57 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  29.77 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  39.76 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  33.86 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  29.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 187 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>