144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3036 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3036  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4928  hypothetical protein  61.24 
 
 		 195 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2014  hypothetical protein  52.6 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1418  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  50.86 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  50.86 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  49.72 
 
 		 182 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2205  hypothetical protein  52.53 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1765  hypothetical protein  49.71 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  36.63 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  31.89 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  27.59 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  26.9 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.9 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  26.9 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  26.9 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  26.37 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  26.92 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.21 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  26.9 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  28.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  27.07 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  26.21 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  25.52 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  26.37 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  32.43 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  31.63 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  26.95 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  28.98 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  25.16 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000414368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  28.48 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  23.2 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  23.37 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5173  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3621  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 371 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  25.66 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  26.11 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 383 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  25.41 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  25.41 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  25.41 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  26.23 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  26.23 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  24.35 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  27.7 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  27.7 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1881  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.59 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  24.59 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0253  acetyltransferase  25.34 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  24.83 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  27.7 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1622  acetyltransferase  22.83 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000172375  normal  0.0165729 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2654  acetyltransferase  28.95 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  23.87 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1514  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  34.43 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  24.34 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>