124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2205 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2205  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2014  hypothetical protein  82.11 
 
 
191 aa  329  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1418  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4928  hypothetical protein  53.85 
 
 
195 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3036  hypothetical protein  53.76 
 
 
185 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  49.43 
 
 
182 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  49.43 
 
 
195 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  49.43 
 
 
195 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1765  hypothetical protein  50.28 
 
 
194 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  36.14 
 
 
173 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  32.92 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.35 
 
 
347 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  27.03 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  27.33 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.32 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  27.57 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  25.32 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  25.82 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  25.81 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  26.78 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  26.2 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
185 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  25.82 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  25.82 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  25.82 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.82 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  26.23 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  23.08 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0364  hypothetical protein  22.67 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.204641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001020  putative ribosomal protein N-acetyltransferase  28.95 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  25.27 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  23.42 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  28 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1259  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.68 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.542192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.29 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  23.68 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  23.03 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.03 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  23.03 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  25.82 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  23.49 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  23.03 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>