52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2550 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  100 
 
 		 481 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  71.93 
 
 		 481 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  93.35 
 
 		 498 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  56.94 
 
 		 483 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.2 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  28.01 
 
 		 564 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.8 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.53 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  27.82 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  31.55 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  33.75 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  26.92 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  27.47 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  28.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  28.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.6 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  25.77 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  29.26 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  27.07 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  27.96 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  26.68 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  30.31 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  35.38 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  31.36 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  28.67 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  31.13 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  25.19 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  30.48 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  27.1 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  31.03 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  32.81 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  29.84 
 
 		 156 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  29.15 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  31.93 
 
 		 157 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  41.03 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  37.25 
 
 		 160 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  37.25 
 
 		 160 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 151 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 151 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 151 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.92 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  29.75 
 
 		 157 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  36.27 
 
 		 160 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  31.2 
 
 		 144 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  27.98 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>