34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0797 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.94 
 
 		 423 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  80.89 
 
 		 387 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.2 
 
 		 388 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  84.75 
 
 		 388 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.33 
 
 		 389 aa  768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 388 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.94 
 
 		 388 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  77.52 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  75.32 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  75.06 
 
 		 386 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.92 
 
 		 387 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  46.28 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.89 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  45.21 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  49.73 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  46.81 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.26 
 
 		 368 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.74 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.26 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.12 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  40.63 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  38.64 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.82 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  34.44 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.77 
 
 		 818 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.39 
 
 		 811 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.02 
 
 		 811 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.29 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.29 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.29 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.29 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.29 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.63 
 
 		 807 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>