43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2614 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  67.56 
 
 		 300 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  65.55 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  62.93 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  63.61 
 
 		 299 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  64.07 
 
 		 302 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  62.37 
 
 		 300 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  37.46 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  29.87 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  38 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  33.55 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  34.44 
 
 		 382 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  32.89 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  32.24 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  27.45 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  26.62 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0506  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 403 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1836  hypothetical protein  33.05 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0484  hypothetical protein  25.17 
 
 		 166 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.875691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  33.64 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  30.08 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  28 
 
 		 196 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.29 
 
 		 515 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0844  hypothetical protein  28.28 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0384719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 		 450 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.74 
 
 		 498 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  26.55 
 
 		 377 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5552  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000569717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5604  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000610114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 432 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5519  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 433 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 432 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1314  hypothetical protein  28.57 
 
 		 80 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>