20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2129 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  100 
 
 
465 aa  965    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  32.75 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  30.94 
 
 
796 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  34.27 
 
 
665 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  26.67 
 
 
621 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  27.12 
 
 
719 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  24.38 
 
 
743 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.81 
 
 
667 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.7 
 
 
741 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  21.9 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  23.32 
 
 
731 aa  48.5  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  26.73 
 
 
248 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  34.78 
 
 
666 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  30.89 
 
 
797 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.92 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  41.1 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  22.81 
 
 
283 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  24.62 
 
 
587 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  29.23 
 
 
718 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>