39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2000 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  45.96 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  34.09 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  31.18 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.07 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  28.52 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  30.25 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  30.57 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  31.1 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  27.82 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.84 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  30.03 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  30.03 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  29.18 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  29.18 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  28.37 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  29.18 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  29.7 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  30.33 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  27.78 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  27.65 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  27.65 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  23.36 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  38.02 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  26.19 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  26.17 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  29.03 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  27.46 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  24.09 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  25.56 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  24.37 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.58 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  23.23 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  26.27 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>