20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0235 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  48.6 
 
 		 709 aa  679    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1463    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0456  phosphotransferase domain-containing protein  25.57 
 
 		 679 aa  136  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.358651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  29.55 
 
 		 883 aa  54.3  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  28.49 
 
 		 894 aa  53.9  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  26.56 
 
 		 906 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  22.82 
 
 		 877 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.34 
 
 		 909 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  22.67 
 
 		 889 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  30.77 
 
 		 894 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  30.77 
 
 		 894 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  27.74 
 
 		 1011 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  23.43 
 
 		 943 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3207  ABC transporter related  35.44 
 
 		 227 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  30.91 
 
 		 853 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  29.63 
 
 		 888 aa  44.3  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  34.38 
 
 		 884 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  30.12 
 
 		 268 aa  44.3  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  27.08 
 
 		 938 aa  44.3  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0201  ABC transporter related  33.82 
 
 		 237 aa  43.9  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>