20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2903 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  47.67 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  47.88 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  45.51 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  38.98 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  39.29 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  28.21 
 
 		 434 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  26.95 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  31.37 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  30.4 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  29.84 
 
 		 437 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  26.95 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  27.78 
 
 		 885 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  25.53 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  21.82 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  26.77 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  28.97 
 
 		 888 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  32.31 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>