More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2401 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.41 
 
 		 703 aa  974    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.55 
 
 		 706 aa  1011    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 706 aa  1449    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.38 
 
 		 706 aa  968    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.71 
 
 		 719 aa  871    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.85 
 
 		 712 aa  876    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.81 
 
 		 707 aa  969    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.79 
 
 		 700 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.48 
 
 		 704 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 702 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 		 703 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.04 
 
 		 765 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 714 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 767 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  41.57 
 
 		 700 aa  544  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 786 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 779 aa  541  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 829 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 772 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 772 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 772 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 818 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 819 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 819 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 904 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 		 778 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 698 aa  525  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.6 
 
 		 717 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.71 
 
 		 685 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 706 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.47 
 
 		 692 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 695 aa  525  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 689 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 904 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 827 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.32 
 
 		 701 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 		 815 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 817 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  40 
 
 		 818 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 694 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.55 
 
 		 740 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 862 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 702 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.55 
 
 		 818 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.52 
 
 		 832 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.45 
 
 		 842 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.26 
 
 		 842 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 822 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 		 781 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 908 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 		 763 aa  487  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 		 779 aa  482  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 		 805 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.18 
 
 		 776 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.01 
 
 		 815 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.35 
 
 		 818 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 827 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 818 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 		 679 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 846 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 		 822 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.52 
 
 		 846 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 		 812 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.36 
 
 		 753 aa  479  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.66 
 
 		 701 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.66 
 
 		 818 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.23 
 
 		 689 aa  473  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.57 
 
 		 790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 678 aa  467  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 903 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 		 690 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.26 
 
 		 690 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 773 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 787 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.2 
 
 		 720 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 		 850 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 		 692 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.5 
 
 		 682 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.34 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.52 
 
 		 846 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 		 686 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.84 
 
 		 747 aa  457  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.58 
 
 		 681 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.26 
 
 		 691 aa  456  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.05 
 
 		 728 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 		 682 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.6 
 
 		 682 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 706 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.51 
 
 		 672 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.54 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>