More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1367 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  75.65 
 
 		 461 aa  734    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  80.04 
 
 		 461 aa  768    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1367  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 460 aa  947    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  75.27 
 
 		 460 aa  713    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1251  argininosuccinate lyase  78.91 
 
 		 463 aa  740    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1327  argininosuccinate lyase  72.77 
 
 		 466 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1327  argininosuccinate lyase  76.74 
 
 		 468 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.456779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  49 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  47.57 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  47.68 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  48 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  46.9 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.48 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  46.61 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.95 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  44.71 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.52 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  46.84 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.52 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  45.2 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  46.41 
 
 		 461 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.33 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  45.1 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  45.86 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  49.29 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  47.83 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 		 499 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  46.99 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  45.98 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 		 462 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  46.85 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  45.43 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  45.23 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  46.14 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  45.15 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  44.86 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  46.82 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  45.45 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 		 457 aa  415  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  46.14 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  45.66 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00111  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.642056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  45.88 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  44.35 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  44.08 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  43.43 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  44.74 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00111  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>