More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0336 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
355 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.445953  normal  0.241601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.12 
 
 
351 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
345 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76093  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
340 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
317 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1416  nucleotide sugar dehydratase, putative  27.59 
 
 
352 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.439402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
318 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  28.48 
 
 
326 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
343 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
343 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
514 aa  116  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.75 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
311 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.21 
 
 
318 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.11 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
319 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.66 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  29.7 
 
 
340 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  29.7 
 
 
340 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
317 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
309 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
311 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
340 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
311 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.99 
 
 
311 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
313 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
335 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
313 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
348 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
329 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
319 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
330 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
319 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
313 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.31 
 
 
345 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
336 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
348 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
348 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.9 
 
 
337 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.9 
 
 
337 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
348 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
318 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
348 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
313 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
346 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
345 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
312 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
313 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
356 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
318 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
350 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.81 
 
 
337 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
311 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.39 
 
 
314 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.44 
 
 
320 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.64 
 
 
331 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.92 
 
 
329 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883785  normal  0.146231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
348 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
322 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000493434  normal  0.801041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
308 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  29.87 
 
 
337 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.74 
 
 
327 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.34 
 
 
316 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
331 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
313 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  31.3 
 
 
325 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
365 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
342 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
333 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.81 
 
 
350 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
346 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
345 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
317 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.23 
 
 
330 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
337 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0779716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.05 
 
 
336 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  29.15 
 
 
410 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
371 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
320 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
351 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.151939  normal  0.0166428 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28493  predicted protein  29.23 
 
 
360 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000203706  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33729  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
360 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000109637  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>