142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4708 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 113 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 113 aa  185  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  60.2 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  61.22 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  61.22 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  61.22 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  61.22 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  60.2 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  60.2 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  60.2 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  60.2 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  58.33 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  59.38 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  58.33 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  57.14 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  56.12 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  57.3 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  57.3 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  57.3 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  58.43 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  55.1 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  55.1 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  54.08 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  56.18 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  36.67 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  36.67 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  36.67 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  36.67 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  41.24 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  40.21 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  40.21 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  40.21 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  40.21 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  40.21 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  40.21 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  36.08 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  36.08 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  36.08 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  35.56 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  38.89 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  38.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  35.87 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  32.61 
 
 		 221 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  38.89 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  34.38 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  38.82 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  33.73 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  33.73 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  36.25 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  37.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  43.33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  43.33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  33.73 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0611  IS66 Orf2 family protein  33.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  33.73 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0639  IS66 Orf2 family protein  33.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  34.48 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  37.84 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  29.29 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  41.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4975  IS66 Orf2 like  32.32 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000117762  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  34.04 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  34.04 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  34.04 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  29.79 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  34.04 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  32.18 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  42.55 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  32.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  41.18 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>