194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3754 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  74.05 
 
 		 228 aa  277  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0443  nitroreductase  64.67 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0434  nitroreductase  64.67 
 
 		 214 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  53.76 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  49.07 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  45.18 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  46.49 
 
 		 189 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  37.21 
 
 		 300 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  31.11 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  32.29 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  36.52 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  32.14 
 
 		 169 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  36.97 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  29.79 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  32.14 
 
 		 169 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  32.09 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  34.05 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  29.31 
 
 		 191 aa  89  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.91 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  33.16 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  36.02 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  29.38 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  35.76 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  33.83 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  32.18 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  28.27 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  29.44 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  31.87 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  29.07 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  30.6 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  30.3 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  33.75 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  31.87 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  31.87 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  35.14 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  36.94 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  32 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  29.76 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  31.32 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  33.77 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  29.03 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  33.11 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  29.89 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  33.77 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  32.1 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  29.76 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  29.67 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  28.33 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  29.67 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  32.07 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  31.48 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  30.63 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  29.12 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  39.74 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  27.17 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  28.02 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  30.86 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  26.67 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  30.95 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  30.22 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  28.48 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  34.59 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  28.96 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  29.28 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  32.39 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  32.68 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0050  nitroreductase  37.29 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  32.05 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  32.05 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  26.16 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.9 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.91 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  34.05 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0695  nitroreductase  33.52 
 
 		 192 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264494  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  32.61 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  26.11 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  32.1 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>