211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4587 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  68.84 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0434  nitroreductase  69.52 
 
 		 214 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0443  nitroreductase  69.52 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  58.12 
 
 		 192 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  54.5 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  47.85 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  52.94 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  41.83 
 
 		 186 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  34.44 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  36.22 
 
 		 300 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  43.42 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  39.67 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  33.33 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  37.58 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  35.71 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  32.04 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  37.2 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  35.84 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  36.98 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  34.19 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  35.15 
 
 		 182 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  33.33 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  30.18 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  33.74 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  32.79 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  35.15 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  32.02 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  35.15 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  35.1 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  35.15 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  33.12 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  32.18 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  31.15 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  30.64 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  28.41 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  27.78 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  35.15 
 
 		 182 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  33.51 
 
 		 182 aa  88.2  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  32.72 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  35.76 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  33.91 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  32.72 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  35.1 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  31.87 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  29.83 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  32.95 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  31.87 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  35.76 
 
 		 185 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  32.77 
 
 		 182 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  32.95 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  32.95 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  31.21 
 
 		 182 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  33.53 
 
 		 182 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  33.86 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  44.37 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  34.03 
 
 		 194 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  33.74 
 
 		 183 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  31.43 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  32.97 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  29.65 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  29.65 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  35.67 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  35.09 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  34.62 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  31.38 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  30.11 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  34.57 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  33.92 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  33.92 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  33.92 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  33.92 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  32.73 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  38.89 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  34.1 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0050  nitroreductase  38.64 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  31.48 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.9 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  34.03 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  32.22 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  31.35 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  29.28 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  33.13 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  33.54 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  33.89 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  34.78 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>