45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1158 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  81.21 
 
 		 298 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  54.41 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  51.3 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  43.57 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  45.49 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  52.11 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  42.81 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  39.04 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  38.91 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  38.25 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  38.38 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  39.66 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  39.31 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  38.28 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  38.25 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  38.25 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.31 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  34.07 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  33.7 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.76 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  47.02 
 
 		 152 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  31.58 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  50.43 
 
 		 151 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  27.74 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  27.01 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  28.36 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  27.63 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  25.94 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  26.61 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.38 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.01 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  26.64 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.7 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  25.37 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  26.14 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  25.74 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.74 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  26.45 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  28.7 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.7 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  28.83 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  32.63 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>