31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3672 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 387 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  79.9 
 
 		 388 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.72 
 
 		 423 aa  607  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.92 
 
 		 388 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.72 
 
 		 389 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.23 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.65 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  74.42 
 
 		 387 aa  597  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.23 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  74.93 
 
 		 386 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  73.89 
 
 		 386 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  46.23 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  44.95 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  48.13 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.95 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.52 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.82 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  43.05 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  43.58 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  41.78 
 
 		 375 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  36.78 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.74 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.44 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  22.34 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.05 
 
 		 811 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.7 
 
 		 886 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.11 
 
 		 818 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.1 
 
 		 863 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.6 
 
 		 807 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>