91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2862 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  62.2 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  61.75 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  60.49 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  61.04 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  77.45 
 
 		 205 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  42.34 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  51.52 
 
 		 364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  55.96 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  46.35 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  56.5 
 
 		 400 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  46.35 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  48.15 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  47.45 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  51.11 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  49.12 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  45.99 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  45.99 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  46.15 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  49.79 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  43.45 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  49.78 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  50.43 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  51.33 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  43.43 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  47.6 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  48.23 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  47.66 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  47.79 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  38.7 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  43.75 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  48.98 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.3 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.3 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  45.15 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  42.11 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  40.08 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  42.34 
 
 		 503 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  35.01 
 
 		 925 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  38.89 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  43.68 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  40.71 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  39.56 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  43.5 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  41.67 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  39.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  41.5 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  41.5 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  36.9 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  37.22 
 
 		 192 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  37.64 
 
 		 195 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.5 
 
 		 225 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.53 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  27.62 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  27.81 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  28.32 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  22.28 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  25.56 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  26.19 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  31.51 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  30.22 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  28.74 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  26.06 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.54 
 
 		 818 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  25.77 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  25.66 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  24.37 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.17 
 
 		 842 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  27.42 
 
 		 188 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  26.26 
 
 		 188 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  25.4 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  27.17 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  26.51 
 
 		 187 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  27.33 
 
 		 206 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  31.18 
 
 		 799 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  22.29 
 
 		 224 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33250  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.044034  normal  0.0230066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  28.48 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  22.29 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  21.66 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  24.52 
 
 		 159 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  28.83 
 
 		 216 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>