89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0911 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  73.09 
 
 		 605 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  72.1 
 
 		 605 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  72.64 
 
 		 604 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  72.5 
 
 		 604 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  72.57 
 
 		 605 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  72.17 
 
 		 604 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  71.92 
 
 		 605 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  72.87 
 
 		 604 aa  849    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  100 
 
 		 602 aa  1188    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  73.22 
 
 		 607 aa  853    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  69.6 
 
 		 603 aa  812    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  35.76 
 
 		 661 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  38.17 
 
 		 629 aa  330  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  36.97 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  35.28 
 
 		 617 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  33.72 
 
 		 603 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 603 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  40.17 
 
 		 628 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  38.93 
 
 		 635 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  33.95 
 
 		 631 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  36.1 
 
 		 394 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  36.1 
 
 		 396 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  28.14 
 
 		 653 aa  217  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  32.07 
 
 		 625 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  28.38 
 
 		 603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  29.57 
 
 		 674 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  29.21 
 
 		 555 aa  200  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 619 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 595 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  27.24 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  28.69 
 
 		 603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  27.2 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  28.36 
 
 		 672 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  28.97 
 
 		 627 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  28.75 
 
 		 627 aa  190  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  29.2 
 
 		 689 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  28.53 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  28.77 
 
 		 628 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  29.22 
 
 		 657 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  28.32 
 
 		 672 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  27.05 
 
 		 634 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  28.17 
 
 		 607 aa  187  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.89 
 
 		 634 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  28.9 
 
 		 689 aa  186  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.74 
 
 		 634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  26.39 
 
 		 603 aa  185  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  27.65 
 
 		 617 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  30 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  27.94 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  27.36 
 
 		 626 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  25.62 
 
 		 634 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  28.14 
 
 		 658 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  25.37 
 
 		 666 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  29.75 
 
 		 621 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  25.95 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  33.13 
 
 		 678 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  27.01 
 
 		 705 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  32.84 
 
 		 678 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 678 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  29.75 
 
 		 573 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  32.82 
 
 		 678 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  32.82 
 
 		 678 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  32.82 
 
 		 678 aa  144  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  32.82 
 
 		 678 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 678 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 678 aa  144  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  31.38 
 
 		 680 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  31.38 
 
 		 680 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  31.38 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  31.38 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  31.38 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  27.55 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  28.64 
 
 		 576 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  32.62 
 
 		 704 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  24.16 
 
 		 677 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  32.42 
 
 		 682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  28.33 
 
 		 721 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  27.85 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  28.02 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  25.89 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  25.89 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  26.38 
 
 		 525 aa  101  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 356 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 378 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 400 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 643 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  26.12 
 
 		 407 aa  44.3  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2555  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.35 
 
 		 606 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>