84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4105 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  46.33 
 
 
231 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  46.33 
 
 
231 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.84 
 
 
231 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.98 
 
 
229 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  47.53 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.64 
 
 
230 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.19 
 
 
230 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.07 
 
 
228 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.6 
 
 
230 aa  175  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  41.3 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  40.43 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.74 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  41.88 
 
 
235 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  46.9 
 
 
233 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.81 
 
 
230 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.12 
 
 
227 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.57 
 
 
235 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  44.78 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.84 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  43.04 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.79 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.13 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.18 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  43.04 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  45.54 
 
 
227 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  43.91 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  45.74 
 
 
230 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.41 
 
 
226 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.61 
 
 
227 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.1 
 
 
230 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  44.89 
 
 
224 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.86 
 
 
229 aa  158  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.66 
 
 
226 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.66 
 
 
226 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.64 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  39.83 
 
 
231 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  43.48 
 
 
226 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  43.48 
 
 
227 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  43.84 
 
 
226 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.91 
 
 
226 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  43.04 
 
 
226 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.72 
 
 
230 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.82 
 
 
224 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.33 
 
 
241 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.42 
 
 
227 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  46.84 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  47.37 
 
 
185 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  41.58 
 
 
217 aa  144  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.1 
 
 
229 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1387  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.96 
 
 
235 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.88 
 
 
223 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.64 
 
 
230 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.26 
 
 
231 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.63 
 
 
234 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  40.49 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  40.49 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.07 
 
 
238 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.57 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.5 
 
 
227 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.04 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.12 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  129  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.31 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.4 
 
 
226 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  35.06 
 
 
232 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.45 
 
 
229 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  39.27 
 
 
226 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  39.37 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.61 
 
 
230 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  39.53 
 
 
230 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.79 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.91 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.97 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  41.76 
 
 
224 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.55 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  31.47 
 
 
228 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.32 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.32 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  33.94 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.31 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  30.59 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>