50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3538 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
133 aa  276  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5065  hypothetical protein  67.97 
 
 
134 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0628651  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6290  hypothetical protein  65.08 
 
 
136 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3796  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60 
 
 
143 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266434  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1414  hypothetical protein  45.31 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0194665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6720  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.27 
 
 
141 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  0.793451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1708  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.66 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1448  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.46 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.977319  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3789  hypothetical protein  42.97 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.88 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.899317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.37 
 
 
158 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  34.25 
 
 
169 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.71 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.43 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.43 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.85 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  25.35 
 
 
329 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.36 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  36.23 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  29.87 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  31.08 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.51 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.03 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.26 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.96 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.39 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2477  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.63 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0972892  normal  0.0646639 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  26.28 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.43 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.31 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01613  hypothetical protein  26.92 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  24 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  25.68 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.94 
 
 
157 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.25 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.76 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.55 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  28.77 
 
 
160 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  28.95 
 
 
319 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
161 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>