19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2943 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 593 aa  1222    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.47 
 
 		 934 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  20.61 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  19.37 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  20.92 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  21.36 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  23.37 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  24.85 
 
 		 497 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  21.83 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  22.43 
 
 		 415 aa  47.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 		 447 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  21.01 
 
 		 797 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.69 
 
 		 1009 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  20.9 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  21.51 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 		 534 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 		 432 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.08 
 
 		 2272 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>