More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2480 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2480  processing peptidase  100 
 
 
409 aa  857    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1462  peptidase M16 domain protein  38.83 
 
 
413 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287908  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  36.05 
 
 
418 aa  275  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2190  peptidase M16 domain-containing protein  37.97 
 
 
413 aa  275  8e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2224  peptidase M16-like protein  38.63 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.606568  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  28.68 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  30.66 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  29.01 
 
 
413 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  30.6 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  29.01 
 
 
413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  28.75 
 
 
413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 
438 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  28.75 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  28.75 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  28.75 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  28.75 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  28.75 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  28.75 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 
417 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  29.9 
 
 
445 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 
418 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 
411 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  29.8 
 
 
421 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  29.1 
 
 
424 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  29.61 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  31.01 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  31.14 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  29.71 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  28.29 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  29.1 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  28.01 
 
 
419 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  28.78 
 
 
442 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 
429 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  29.27 
 
 
429 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 
429 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 
457 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  30.94 
 
 
462 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  28.61 
 
 
423 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.57 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  29.54 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  28.09 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 
462 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  27.67 
 
 
413 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  29.16 
 
 
419 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  29.15 
 
 
418 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  28.61 
 
 
451 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  29.5 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  30.02 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  28.78 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  28.75 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  27.92 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
422 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  27.3 
 
 
421 aa  162  8.000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  29.5 
 
 
435 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  28.78 
 
 
443 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  28.85 
 
 
424 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  27.75 
 
 
408 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  29.98 
 
 
421 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  28.86 
 
 
467 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 
422 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  29.62 
 
 
439 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  27.95 
 
 
441 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 
453 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  28.23 
 
 
441 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  28.46 
 
 
477 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  29.15 
 
 
451 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  28.23 
 
 
438 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  26.96 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  28.26 
 
 
434 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  27.68 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  28.35 
 
 
418 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.41 
 
 
945 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  28.02 
 
 
420 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  28.74 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
896 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.68 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0050  peptidase M16 domain protein  29.22 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  29.92 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  30.43 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1616  peptidase M16 domain protein  30.91 
 
 
421 aa  146  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  26.98 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  27.94 
 
 
432 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  27.21 
 
 
432 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  26.14 
 
 
418 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  26.2 
 
 
422 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  25.38 
 
 
418 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  26.83 
 
 
451 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  27.17 
 
 
429 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25.5 
 
 
419 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  25.99 
 
 
429 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  29.17 
 
 
420 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  26.58 
 
 
432 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  28.07 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  27.01 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  29.22 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4497  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  27.91 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  28.49 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>