165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2570 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 142 aa  292  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  43.15 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  39.72 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  41.26 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  36.88 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  38.89 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  40.82 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  40.82 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  38.89 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  40.14 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.96 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  36.62 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.64 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  36.69 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  37.93 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  37.41 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  34.92 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  35.51 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  32.12 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  33.07 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  34.07 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  29.5 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  30.58 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  33.6 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  31.4 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.15 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.43 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.51 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.85 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.85 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  40.85 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.22 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.08 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  32.82 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.99 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  29.25 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.46 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.01 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.61 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.1 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.82 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  29.06 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.95 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.47 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.74 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.93 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  31.11 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  27.93 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.82 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.63 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.21 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  27.08 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.28 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.56 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.81 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  29.77 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.36 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  26.39 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>