More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1665 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  54 
 
 
311 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.28 
 
 
314 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.44 
 
 
318 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.47 
 
 
317 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.1 
 
 
315 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.44 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.1 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
311 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.25 
 
 
308 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.65 
 
 
324 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  44.55 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.4 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  45.02 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.95 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.13 
 
 
316 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  45.22 
 
 
309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.63 
 
 
311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.35 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.55 
 
 
339 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.18 
 
 
339 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.41 
 
 
314 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  41.9 
 
 
319 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  42.19 
 
 
323 aa  235  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  44.37 
 
 
376 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.97 
 
 
375 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.97 
 
 
375 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.8 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.53 
 
 
335 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.04 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.55 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.51 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.78 
 
 
371 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  47.6 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.27 
 
 
325 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  46.39 
 
 
292 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.49 
 
 
337 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.52 
 
 
315 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 
312 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.41 
 
 
339 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  41.4 
 
 
337 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.64 
 
 
310 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.36 
 
 
338 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.64 
 
 
310 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.64 
 
 
310 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.14 
 
 
311 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.98 
 
 
316 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.72 
 
 
337 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 
307 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  39.68 
 
 
339 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.77 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.49 
 
 
313 aa  225  7e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  44.1 
 
 
320 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  42.72 
 
 
338 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.63 
 
 
320 aa  225  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.36 
 
 
331 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.86 
 
 
351 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  42.52 
 
 
341 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44 
 
 
338 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.63 
 
 
327 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.9 
 
 
344 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.86 
 
 
342 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.88 
 
 
320 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.62 
 
 
344 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  42.22 
 
 
348 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.88 
 
 
329 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.84 
 
 
326 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.32 
 
 
319 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.33 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  48.55 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.38 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  47.81 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.4 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.86 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  45.57 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  45.64 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  46.01 
 
 
311 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.94 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.94 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.34 
 
 
359 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.59 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.91 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  41.01 
 
 
350 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.81 
 
 
319 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.27 
 
 
344 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.14 
 
 
301 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  41.81 
 
 
321 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  41.38 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  41.38 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.62 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  41.38 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  42.68 
 
 
328 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  41.38 
 
 
319 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  41.38 
 
 
352 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  41.38 
 
 
319 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.44 
 
 
339 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.48 
 
 
300 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.48 
 
 
300 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>