More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1403 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  61.74 
 
 		 266 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.23 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  59.47 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.78 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  61.74 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  61.74 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.93 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  61.36 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  61.76 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  61.76 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  61.76 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  61.39 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  58.62 
 
 		 267 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  57.85 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.78 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  54.79 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  53.82 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  56.11 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  63.32 
 
 		 262 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  64.79 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  61.92 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  58.52 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  57.52 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  59 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  52.35 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  53.52 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.78 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.94 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3677  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 797 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  36.24 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  31.66 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  34.94 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  33.58 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.58 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.58 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  33.21 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  33.21 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.07 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>