91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0562 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  53.66 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  43.29 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  34.07 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  34.21 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  34.07 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  32.39 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  37.86 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  33.62 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  30.5 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  34.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  32.37 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  27.14 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  32.29 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  35.05 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  35.05 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  36.7 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  36.7 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  34.21 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  28.78 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  36.7 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  28.18 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  35.35 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  37.35 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  35.35 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  38.14 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  30.77 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  28.77 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  33.94 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  32.04 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  34.86 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  32.17 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  25.74 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  28.47 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  34.74 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  31.13 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  22.22 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  29.82 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  34.55 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  34.55 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  37.61 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  30.1 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  30.1 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  35.4 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  36.99 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  38.36 
 
 		 165 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  32.86 
 
 		 144 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  26.47 
 
 		 143 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  26.27 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  30.93 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  27.43 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  36.62 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  29.67 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>