74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0312 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.14 
 
 		 189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.08 
 
 		 189 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.34 
 
 		 175 aa  214  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  37.57 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  36.07 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.72 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.15 
 
 		 362 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  33.33 
 
 		 239 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  30.85 
 
 		 354 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.34 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.95 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  32.95 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  32.95 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  33.14 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.73 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  32.37 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  31.72 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  31.72 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  31.18 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  31.72 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  31.72 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  32.97 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.06 
 
 		 364 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  31.11 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.73 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.74 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.87 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.81 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  31.85 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.04 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5375  hypothetical protein  45.33 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.392977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.29 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  28.4 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  27.87 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  28 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  32.77 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  27.54 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.13 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  26.74 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  26.67 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.87 
 
 		 330 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  29.92 
 
 		 332 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  26.28 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.46 
 
 		 430 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  25.86 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  26.95 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0744  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.18 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.82 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.42 
 
 		 293 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  31 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  26.81 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1795  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.66 
 
 		 298 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.668021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  30.83 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3334  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  24.66 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  30.3 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.21 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  30.95 
 
 		 153 aa  42  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  27.36 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>