44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0441 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  100 
 
 
332 aa  669    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6305  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.31 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.85 
 
 
203 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  36.08 
 
 
203 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.17 
 
 
362 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.89 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  28.33 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.95 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  30.46 
 
 
211 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  29.86 
 
 
239 aa  63.2  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.31 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.85 
 
 
202 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  26.55 
 
 
249 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.62 
 
 
175 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.92 
 
 
191 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  27.82 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 
201 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  26 
 
 
200 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.38 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  29.01 
 
 
200 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.72 
 
 
189 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  51.43 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  26.21 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  26.21 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  26.21 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  27.14 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.53 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.34 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  25.52 
 
 
200 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.43 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.57 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  25.52 
 
 
200 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0744  filamentation induced by cAMP protein Fic  38 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>