43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0192 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  85.29 
 
 		 136 aa  253  7e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  70.59 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  61.03 
 
 		 134 aa  174  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  47.76 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.72 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.42 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  31.2 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.45 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.25 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  30.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.53 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.92 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.08 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  30.95 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.01 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.22 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.57 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.25 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.11 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.62 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.49 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.25 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.76 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.09 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.09 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.53 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.5 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.94 
 
 		 135 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.83 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.2 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.2 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.63 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 908 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.75 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>