30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3100 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 1098 aa  2244    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.143257 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 		 665 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.24 
 
 		 767 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1371 aa  57.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.64 
 
 		 672 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 		 963 aa  53.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  28.07 
 
 		 311 aa  52.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 639 aa  52  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 649 aa  51.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.5 
 
 		 2145 aa  49.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 454 aa  48.5  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 568 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 568 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1212 aa  48.5  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 		 1908 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 1186 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 843 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 578 aa  47.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.95 
 
 		 801 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1215 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  41.94 
 
 		 1123 aa  46.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.48 
 
 		 725 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 284 aa  45.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 1636 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 1192 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.95 
 
 		 825 aa  45.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2272 aa  44.7  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  26.38 
 
 		 1922 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>