More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2886 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  100 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  64.53 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  62.66 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  64.1 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  64.1 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  64.1 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  64.1 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  63.68 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  62.66 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  63.68 
 
 		 261 aa  304  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  64.1 
 
 		 261 aa  304  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  63.68 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  63.68 
 
 		 260 aa  304  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  63.4 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  62.39 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  61.37 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  63.68 
 
 		 261 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  63.68 
 
 		 261 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  63.68 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  61.7 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  63.25 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  61.11 
 
 		 264 aa  299  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  64.1 
 
 		 263 aa  299  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  61.54 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  62.39 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  62.39 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  62.13 
 
 		 261 aa  298  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  61.97 
 
 		 260 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  63.68 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  61.97 
 
 		 260 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  61.97 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  61.11 
 
 		 260 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  61.11 
 
 		 260 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  61.54 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  61.11 
 
 		 260 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  62.39 
 
 		 260 aa  294  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  62.82 
 
 		 259 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  61.82 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  59.23 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  59.48 
 
 		 260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  64.52 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  63.89 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  59.23 
 
 		 265 aa  278  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  57.51 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  57.51 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  60.91 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  58.37 
 
 		 265 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  56.22 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  58.8 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  60.63 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  58.45 
 
 		 266 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  58.45 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  58.45 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  58.45 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  55.36 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  54.94 
 
 		 265 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  59.53 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  55.36 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  55.36 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  57.08 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  58.18 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  59.36 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  57.87 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  62.67 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  57.27 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  58.48 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  58.04 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  56.47 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  55.98 
 
 		 260 aa  254  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  56.9 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  59.55 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  58.26 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  57.14 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  57.85 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  54.55 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  57.96 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  54.55 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  56.65 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  56.5 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  60.38 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  59.91 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  60.38 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  59.91 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  59.91 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  59.91 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  59.91 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  54.94 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  57.08 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  57.08 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  56.89 
 
 		 260 aa  242  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>