63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2771 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  67.32 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  67.8 
 
 		 202 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  64.88 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  65.69 
 
 		 203 aa  257  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.11 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.67 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.31 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  57.07 
 
 		 206 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.07 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  57.07 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.07 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  57.07 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  57.07 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  56.59 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  56.1 
 
 		 206 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.4 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.94 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.02 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.6 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.39 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.15 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.44 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.77 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.44 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.7 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  46.19 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.65 
 
 		 157 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.84 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.81 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.81 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.28 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.27 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  29.27 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.43 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  34.96 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.19 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0880  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.14 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.993404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  33.33 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1002  CDP-diacylglycerol-serine O-phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1046  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0901  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0959  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1129  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4302  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1041  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.43 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0854  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.33 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.68 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 		 199 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  30.51 
 
 		 177 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  33.04 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.33 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.59 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  33.04 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>