50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1492 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  718    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  47.54 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  43.99 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  44.77 
 
 
360 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  45.51 
 
 
348 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  41.4 
 
 
346 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  43.7 
 
 
348 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  39.42 
 
 
343 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  41.94 
 
 
358 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  38.08 
 
 
347 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  40.23 
 
 
350 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  38.95 
 
 
343 aa  275  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  41.18 
 
 
346 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  41.94 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  41.64 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  41.64 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  41.64 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  40.18 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  40.18 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  38.66 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  40.18 
 
 
346 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  41.76 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  40.23 
 
 
351 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  40.7 
 
 
366 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  40.94 
 
 
351 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  38.9 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  39.47 
 
 
350 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  36.44 
 
 
343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  38.24 
 
 
349 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  37.5 
 
 
349 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  36.73 
 
 
347 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  34.26 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  30.68 
 
 
346 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.66 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  27.95 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.3 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  25.14 
 
 
366 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.65 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.6 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.9 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  26.14 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  26.6 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  25.88 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  21.05 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  25 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  21.73 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  22.22 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  20.57 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  21.14 
 
 
388 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  18.18 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>