26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4185 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  33.18 
 
 
202 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  32.73 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  29.91 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  29.37 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  31.22 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  29.14 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  26.75 
 
 
223 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  26.55 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  26.91 
 
 
186 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  28.66 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  29.63 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  28.37 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  26.37 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  29 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  26.64 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  29.03 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  26.58 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  26.56 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  21.05 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  24.12 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3744  hypothetical protein  22.65 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2106  hypothetical protein  26.63 
 
 
227 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.713081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4771  secreted protein  28.65 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>