More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3564 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3564  aldo/keto reductase  100 
 
 
292 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.138533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  32.16 
 
 
344 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  33.09 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  33.81 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
317 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
335 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  30.99 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
313 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
334 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
313 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  30.96 
 
 
343 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  28.81 
 
 
341 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
313 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  29.86 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1108  aldo/keto reductase  29.05 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1041  aldo/keto reductase  29.73 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
343 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
323 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  29.86 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  30.9 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.28 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  31.21 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  30.28 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  30.69 
 
 
323 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  29.24 
 
 
331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  32.75 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  28.77 
 
 
333 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  31.72 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  29.66 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  31.48 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  28.34 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0119  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  29.12 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  30.69 
 
 
339 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
349 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  28.1 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.53 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.76 
 
 
324 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  31.18 
 
 
349 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.53 
 
 
324 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  28.81 
 
 
331 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  29.86 
 
 
327 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  32.34 
 
 
315 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0374  aldo/keto reductase  28.28 
 
 
337 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  32.41 
 
 
324 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  32.41 
 
 
324 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  32.41 
 
 
324 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.41 
 
 
324 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  32.41 
 
 
324 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  29.9 
 
 
325 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  28.82 
 
 
341 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.41 
 
 
324 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
315 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1164  aldo/keto reductase  30.69 
 
 
323 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.123786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
341 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
342 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
334 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
344 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  30.1 
 
 
324 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.45 
 
 
324 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  30.74 
 
 
324 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.66 
 
 
324 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
321 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  30.18 
 
 
314 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
317 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  30.11 
 
 
320 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
314 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
315 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
318 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  28.47 
 
 
347 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  28.42 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  30.23 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  26.64 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.1 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  28.92 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.1 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  27.4 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  30.21 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  29.26 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  25.89 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
313 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
316 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
342 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  28.06 
 
 
343 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>